Las pocas insurrecciones que se produjeron en Centroamérica, como la del fraile Benito Miguelena en Nicaragua o la de José Matías Delgado en El Salvador, fracasaron. En 1821, los territorios que componían la capitanía proclamaron su independencia, y un año después se integraron al imperio mexicano.
Cuando este cayó, se separaron con el nombre de Provincias Unidas de Centroamérica. Debido a sus diferencias, entre 1838 y 1848, Costa Rica, El Salvador, Guatemala, Honduras y Nicaragua se convirtieron en repúblicas independientes.
El caso de Panamá es diferente. Fue primero parte del virreinato del Perú, hasta 1740, cuando resultó transferida al virreinato de Nueva Granada. Luego de la independencia de las colonias formó parte de Colombia, con el nombre de departamento del Istmo. Cuando fueron descubiertos los campos auríferos de California, revivió en EE.UU. la idea de hacer un canal a través del istmo. El proyecto fue llevado a cabo después de una revolución que separó a Panamá de Colombia y que contó con el apoyo de EE.UU.
Tras los movimientos patriotas que se produjeron en toda Latinoamérica, España solo mantuvo el control de algunas islas del Caribe, Cuba y Puerto Rico. Además, República Dominicana, que se había declarado independiente en 1821, volvió a su poder entre 1861 y 1865.
En Cuba, los independentistas lograron unificarse en 1868. Tras una guerra de diez años, que concluyó con el Pacto de Zanjón, no se logró la independencia. En 1895 estalló un nuevo conflicto, en el que destacó José Martí. Tres años después vino la guerra entre España y Estados Unidos, que los peninsulares perdieron. Por el tratado de París, España renunció a Cuba, que logró su independencia, entregó Puerto Rico a Estados Unidos y perdió las islas Guam y las Filipinas en el Pacífico.
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